赛默飞ABI Ion Proton基因测序仪

资料简介：

赛默飞ABI Ion PGM|Ion Proton快速高通量测序基因测序仪简介

Life Technologies 公司研发的 Ion Proton? 基因测序仪采用了新***代半导体测序技术。此前推出的同样基于这***技术的个人化操作基因组测序仪 (PGM? ) ，已成为全球销售*快的测序仪。Ion 技术拥有快速、简单及可扩展等特征，能有效推进临床研究在遗传性疾病等诊断中的发展。

2. 应用领域

可应用于人全基因组、外显子组、转录组测序。

3. 性能介绍

1) 单芯片载入中：为实现优化的性能和简便性，IonProton?系统提供了全新设计的芯片加载机制。

2) 集成的试剂输送：IonProton?测序仪将所有试剂置于仪器前方的单扇门之后，十分方便。

3) 直观的图形界面：Ion Proton?测序仪采用了全新设计且易于使用的直观图形界面，确保了各个水平的用户均能通过仪器设置和操作快速导航。

4) *先进的电子产品：Ion Proton?测序仪采用了先进的电子技术，可*大程度地简化处理高通量系统生成的数据所需的计算硬件。

5) 离子半导体测序芯片：Ion Proton?芯片只需几小时即可提供人类基因组、人类外显子组或整个转录组信息，较其它测序技术更快速。

4. 数据产出

单次运行时间为2h，Ion PI?芯片包括16,500万个反应孔，测序通量为2个人外显子组大小，Ion PII?芯片包括66,000万个反应孔，测序通量为1个人基因组大小。

5. 工作流程

文库构建-模板制备-运行测序-分析数据

6. 系统数据处理编辑

采用先进的硬件可实现***天基因组测序

IonProton?系统是能够实现$1,000基因组的序平台*。它将是可在***天内提供人类基因组规模分析的台仪器系统，包括数据处理、碱基检测和变异体检测。

IonProton?系统采用半导体技术，可提供在几个小时内完成测序所需的速度，而且利用IonProton?测序仪中先进的电子设备，能够***天内在Proton?Torrent服务器—IonProton?系统附带的简单的台式服务器—上实现变异体检测。

IonProton?测序仪采用了*新、*先进的计算硬件(图形处理器(GPU)和现场可编程门阵列(FPGA)技术)，可在测序仪内部实现密集型计算数据处理。随后在Proton?Torrent服务器上进行计算密集程度较低的碱基检测和变异体检测。

IonProton?系统将提的速度和价格优势，可在台式测序仪和台式服务器上实现外显子组、转录组和人类基因组测序，而直到现在，完成这些操作仍需体积较大的测序仪和高端集群。

7. 优势编辑

IonProton?测序仪凭借密度比IonPGM?测序仪高1000倍的芯片，IonProton?测序仪将使得全基因组测序对每个实验室都触手可及。

基于新***代的半导体测序技术，此技术已让IonPGM?测序仪成为世界上销售*快的测序仪.新的高通量芯片将实现让IonProton?测序仪与IonPGM?测序仪相当的运行单日流程，来完成单个人类基因组的测序。

适合于每个实验室，各种应用，各种预算。

快速、简捷、扩展，台式基因组中心。

天津金思德生物拥有中低通量的Ion Torrent PGM Systems和中高通量的Ion Torrent Proton Systems，为用户提供专业全套的二代测序实验室整体解决方案。

赛默飞ABI Ion PGM|Ion Proton快速高通量测序基因测序仪特点：
  快的高通量新***代测序工作流程与快的测序运行时间2-4小时的离子PI芯片
 每周高数量完整测序的运行，具有简单和自动化的工作流（与离子的OneTouch2系统中使用时）
 简单的半导体测序工作流程与强大的和简单的硬件，可以在-没有摄像头的依据，没有光学，没有激光
 可扩展，高通量测序能力，使运行时要么离子PI或离子的PII*芯片，再加上高达200基单读取和灵活的库选项（例如，基因组DNA片段，
有针对性的/外显子，RNA）
 小型台式足迹和安装能力（带有可选的机架）（每个机架上有两个离子质子系统），为客户提供唯的台式基因组中心
 低成本的平台和价格诱人的半导体芯片和试剂的应用范围
 经过验证的离子半导体测序无需复杂的光学系统，并采用天然的核苷酸，以提供高度准确的变异检测，覆盖均匀性和灵敏度，检测低频率变量
 快速和简单的解决方案库范围和试剂盒与各种应用，如基因组测序，外显子组测序，基因组测序和RNA测序低投入的要求
 完整的端至端解决方案，从基本要求与质子洪流服务器和洪流，以变种Suite软件V3.0 
 简单和集成的工具，三***数据分析与跨越单***离子记者软件进行DNA变异分析，配对，或者三人的样本有了突破性离子质子系统的可用性，
快速，高通量测序终于进入所有实验室。
负担得起的测序几乎每***个实验室上***页测序技术都依赖于光学系统的化学和序列信息的数字形式之间的桥梁。这些系统增加了巨大的成本来定序，
他们贬谪到只有大的实验室。通过省去了光学系统，离子质子系统提供了高通量测序更简单，更快速，更具成本效益，
并比其他任何可用的技术更具可扩展性。与台式足迹，低成本的测序试剂，和***个简单的触摸屏用户界面，离子质子系统带来了高吞吐量，
下***代测序几乎每***个实验室。
离子动力：PostLight测序产生位从基地的测序技术的基础离子质子系统利用了充分表征的生化过程：当***个核苷酸掺入到DNA链通过聚合酶，
氢离子（H +）被释放作为副产物。这种氢离子带电荷的质子系统的离子传感器本质上是世界上小的固态pH计，可以检测到。
由于序充斥芯片与***个又***个核苷酸，核苷酸任何添加到DNA模板将被检测为电压的变化，以及离子质子系统会调用基。
如果***个核苷酸是不匹配的特定模板，没有电压变化将被检测并没有基础，直接调用该模板。
大规模平行测序在你的台式离子质子系统的***个主要组成部分是测序芯片。离子PI芯片集成了***个非常密集阵嫁给我们的专有离子传感器> 1.65亿微机械井。
每孔包含不同的DNA模板，使大规模并行测序。与离子PI芯片（1.65亿井）和离子的PII芯片*（6.6亿井），离子质子系统能使全转录到
整个人类基因组测序的范围从以人为尺度的外显子组测序的高通量基因组应用。
正确的工具来获得的成绩轻松，可靠并迅速因为它检测核苷酸掺入无需使用光，离子质子系统采用简单的测序化学可能：天然核苷酸。
没有必要使用昂贵的且易于出错的修饰的碱基，酶***联反应，化学发光，或荧光。直接检测也意味着每个核苷酸的掺入被记录在几秒钟。
因此，你可以做***个完整的测序通常在几小时内运行。

Ion PGM & Ion Proton

快速高通量测序解决方案

Ion Torrent是革新性的半导体芯片测序技术平台。现在，Invitrogen项目服务部将Ion PGM和Ion Proton快速精确的测序服务带到您身边。

Ion AmpliSeq技术——运用超多重PCR扩增捕获目的区域，进行半导体高通量测序和数据分析。

优点：
• 仅需痕量样品-起始模板DNA低至10ng，适用于珍贵样品
• 高效靶向覆盖-运用多重PCR设计实现平均97%靶向覆盖
• 读长-可选择200bp或400bp读长

外显子组测序

超多重PCR外显子捕获技术，覆盖97%以上的外显子区域，60 X以上的测序深度。
提供SNP和In/Del变异检测分析，利用dbSNP和Genome 1000进行变异注释及氨基酸突变注释。

BAC/Fosmid质粒测序：

非模式生物基因组测序工程辅助平台

细菌基因组de novo和重测序：

2011年德***肠出血性大肠杆菌疫情由Ion PGM平台先完成测序鉴定

病毒基因组测序：

快速发现新型病毒

肿瘤基因靶向测序

◆ Cancer Hotspot Panel V2： 靶向50个原癌及抑癌基因，覆盖约2800个已知外显子突变位 点，高4000 X测序深度。
◆ Comprehensive Cancer Panel：靶向409个引用次数多及突变频繁的关键原癌及抑癌基因，350 X以上测序深度。
◆ BCRA1/2 Panel：特异性针对乳腺癌/宫颈癌BCRA1/2检测，1000 X以上测序深度。 Angelina Jolie通过基因诊断降低乳腺 癌发病风险引起全球热议。
◆ Colon and Lung Cancer Panel：特异性靶向结肠癌、肺癌相关22个基因热点区域，1500 X以上的测序深度。

遗传病基因检测

◆ Inherited Disease Panel： 涵盖 700多种常见孟德尔遗传病相关的328个基因 当基因组位置的测序覆盖度 >20x时，生殖细胞系突变检测>90% 神经肌肉疾病涉及237种疾病中88个基因 心脏病涉及143种疾病中61个基因 发育疾病涉及143种疾病中61个基因 代谢疾病涉及44种疾病中28个基因 其他典型遗传性疾病涉及196种疾病中75个基因

Ion AmpliSeq™ Custom Panel：根据研究兴趣设计并定制目的基因的测序服务，可灵活选择测序深度

高通量测序验证平台

PCR测序法：

针对客户感兴趣的DNA区域，我们 提供引物设计和合成、PCR扩增、ABI3730测序和实验结果的初步分析。

MGB探针法：

根据DNA序列设计特异性引物和探针、荧光定量PCR和实验结果分析。

SNaPshot法：

根据DNA序列设计特异性引物、多重PCR进行单碱基延伸、3730毛细管电泳扫描和实验结果分析。

质谱法：

根据DNA序列设计特异性引物、多重PCR进行单碱基延伸、质谱检测和实验结果分析。