1. 按照定位***别分类。可以分为学生***、实验***、研究***生物显微镜。
2. 按照目镜的个数分类。可以分为单目型、双目型、三目型生物显微镜。
按照目镜个数分类3. 按目镜和移动台的相对位置分类。可以分为正置生物显微镜和倒置生物显微镜。正置(常规)生物显微镜的物镜在移动台的上方，倒置生物显微镜的物镜在移动台的下方。
按照目镜和移动台相对位置分类4. 按成像原理分类。可以分为光学生物显微镜和电子生物显微镜。
光学显微镜主要由目镜、物镜、载物台和反光镜(集光镜)组成。目镜和物镜都是凸透镜，焦距不同。物镜的凸透镜焦距小于目镜的凸透镜的焦距。物镜相当于投影仪的镜头，物体通过物镜成倒立、放大的实像。目镜相当于普通的放大镜，该实像又通过目镜成正立、放大的虚像。经显微镜到人眼的物体都成倒立放大的虚像。
显微镜的成像原理电子显微镜是根据电子光学原理，用电子束和电子透镜代替光束和光学透镜，使物质的细微结构在非常高的放大倍数下成像。由于电子束的波长远远小于可见光的波长，所以即使电子束的锥角仅为光学显微镜的1%，电子显微镜的分辨本领仍远远优于光学显微镜。光学显微镜的放大倍率约为2000倍，而现代电子显微镜放大倍率已经超过了300万倍
[1] 。
电子显微镜生物显微镜的基本结构
生物纤维镜的结构1. 镜座。位于显微镜底部，用于支持全镜。
2. 镜臂。位于镜筒后面，通常为弓形，用于支持镜筒和搬移显微镜时握持部位。
3. 镜筒。位于显微镜上方，上接目镜，下接物镜转换器。
4. 物镜转换器。位于镜筒下方的转盘，通常有3~4个圆孔，可装配不同放大率的物镜，可使每个物镜通过镜筒与目镜构成***个放大系统。
5. 移动台。又名载物台、工作台或镜台，用于放置标本。移动台上有两个金属压片夹叫标本夹，用于固定玻片标本。有的载物台上装有推片器用来移动标本，有的载物台本身可以移动。
6. 调焦装置。为了得到清晰的图像，必须调节物镜与标本之间的距离，使物镜的焦点对准标本，这***操作叫调焦。调焦通过粗准焦旋钮和细准焦旋钮来实现。
7. 物镜。安装在镜筒下端的物镜转换器下方，因为它靠近被视物体，故又称接物镜。物镜是决定显微镜性能如分辨力的*重要的构件。物镜的作用是将标本次放大成倒像。***台显微镜备有数个物镜，每个物镜由数片不同球面半径的透镜组成。物镜下端的透镜口径越小，镜筒越长，其放大倍数越高；否则反之。物镜有低倍物镜和高倍物镜，其放大倍数***般刻在物镜的镜筒上，例如4×、8×、10×、……、100×，分别表示4倍、8倍、10倍……、100倍。其中40-65倍叫高倍物镜，90或100倍的称为油浸物镜。
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